É razoável esperar que o PlayOnLinux seja um pouco mais pesado que o nativo. PlayOnLinux depende do vinho, o que traz toda uma camada de sobrecarga de virtualização.
O Steam, por outro lado, é mais um saco de alguns jogos nativos e alguns jogos envoltos em vinho, então alguns serão mais fáceis do que outros, dependendo de quem / como foi portado.
Além disso, a diferença entre os drivers gráficos de código aberto e os drivers propiciatórios pode fazer ou quebrar a experiência de jogo.
Estas são apenas algumas generalizações gerais, algumas especificidades do seu jogo / hardware ajudariam.
Qual é a sua configuração de hardware / driver gráfico? Se você não tiver certeza, isso pode ajudar
lspci | grep VGA