Como @Mat apontou, thescript
provavelmente possui novas linhas do Windows (retorno de carro / CR seguido por feed de linha aka. LF). Comparar:
$ echo : No such file or directoryonfig.conf
: No such file or directoryonfig.conf
$ printf '/[.................]/conf/config.conf\r: No such file or directory\n'
: No such file or directoryonfig.conf
Use dos2unix thescript
para corrigir.