Acho que "cpulimit" é a melhor maneira de controlar o uso da CPU por processo. O cpulimit não age sobre o bom valor ou outras coisas prioritárias de programação, mas sobre o uso real da CPU.
cpulimit
Instale cpulimit
no Linux:
yum install cpulimit
Para limitar o uso da CPU do processo chamado nginx para 40%, digite:
cpulimit -e nginx -l 40
Para limitar o uso da CPU do processo a 40% usando seu PID, insira:
cpulimit -p 3302 -l 40
Onde,
-p: PID de processo. -e: nome do processo. -l: porcentagem de CPU permitida de 0 a 100. -P: nome do caminho absoluto do arquivo do programa executável.