A inicialização de um sistema a partir de um pendrive USB geralmente é útil para ter um sistema móvel (se você precisar inicializar a partir de outro computador), bem como para apagar seus rastros no desligamento. Ele não protege seu sistema de forma diferente de uma inicialização dupla.
Enquanto outras partições não são montadas, o risco de acidentalmente corromper seus dados é menor. Não jogue com /dev/sd*
e você deve estar bem. Um software malicioso pode efetivamente corromper toda a sua unidade, mas isso não é mais arriscado do que no Windows. Você só faz login no Windows com uma conta sem privilégios, correto?
Na verdade, até mesmo uma VM não é 100% segura .
A parte "Normalmente você os tem em rede, portanto qualquer malware com um componente de rede (ou seja, worms) será propagado para onde quer que seu endereçamento / roteamento os permita." também se aplica se você desconectar todos os seus discos rígidos e arrancar a partir de um stick USB. O worm pode voltar mais tarde para infectar seu sistema habitual.
Seu processador não é 100% seguro .
É apenas uma questão de probabilidade e modelo de ameaça.