Como você está usando o Thunar, eu suponho que você esteja usando o xfce (ou xubuntu), então este comportamento é quando você abre o thunar a partir do painel do iniciador usando o ativador do Menu do Diretório. No menu do painel, você pode adicionar dois lançadores diferentes para Thunar, um com o submenu adicional que você tem (chamado Menu Diretório) e outro (chamado Locais) sem o submenu adicional (do jeito que você quiser). Você pode editar seu painel e alterar o ativador do Menu do Diretório para o ativador Locals.
Obs: não tenho certeza dos nomes ingleses dos lançadores ... pode ser algo parecido, mas não exato.