Para possivelmente ajudá-lo a procurar o problema, adicione o seguinte à parte superior dos arquivos .bash_profile e .bashrc :
${BASH_DEBUG:+set -x}
${BASH_DEBUG:+trap 'echo ^^ Line: $LINENO ^^' DEBUG}
Em seguida, em um shell de comando, execute:
BASH_DEBUG=1 bash -l
para iniciar um shell de login, que usará .bash_profile ou sem o -l , que lerá .bashrc .
Para cada linha lida / processada, você obterá uma saída dos comandos executados e o número da linha.