Qual é o objetivo de stty < /dev/null
?
Primeiro, não use vírgula como separador, use espaço, isso simplifica o loop mais tarde.
string2="c0001234.cloud.com c0005678.cloud.com c0009123.cloud.com"
for j in $string2; do
ssh -o StrictHostKeyChecking=no AppAccount@$j sed -i -e 's/var/value/g' file
done
Isso substituirá var
por value
em file
.