Não tenho certeza do que você quer dizer com comando de rota sendo substituído por config, mas você pode usar o comando ip em vez disso (do pacote iproute *):
sudo ip route replace default via 192.168.1.1
sudo ip route flush cache
Ambos os comandos gerenciam (visualizar / editar) as entradas da tabela de roteamento.
Um pouco de conselho - você pode ter a interface ethernet configurada manualmente sem configurar um gateway padrão (apenas um endereço IP e manual / dinâmico encaminhamento, se necessário). Se isso não é uma opção, você pode configurar o cliente dhcp para rejeitar a opção de gateway padrão nessa interface (eth0).