Eu recomendaria a leitura no sistema de arquivos Unix .
O diretório /var/
contém arquivos que mudam com freqüência. O diretório /etc/
contém configurações que normalmente não crescem muito. o diretório /usr/
contém arquivos do SO que não mudam muito fora das atualizações do sistema. Se você tiver aplicativos de terceiros sendo executados em /srv/
ou /opt/
, esses diretórios poderão crescer.