Bem, encontrei a resposta para este problema.
Eu sabia que algumas CPUs da família Sandy Bridge tinham problemas de ruído quando desceram para o estado de energia C3. Isso pode ser resolvido facilmente desativando o estado de energia C3 da bios.
O problema é que, por algum motivo, o kubuntu ignora essa opção no BIOS.
A solução é adicionar essa linha intel_idle.max_cstate=1
ao arquivo: /etc/default/grub
Como explicado neste post: link
Felicidades.