Como usar toda a CPU em um cluster com o PBS

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Sou muito novo no MPI, minhas desculpas se isso parece ingênuo. Eu tenho acesso a um cluster HPC e estou tentando executar um script serial em um cluster de 40 núcleos. Aqui está o meu arquivo PBS:

#PBS -l nodes=1:ppn=40,walltime=5:00:00
#PBS -N name
cd my directory
my command

O script é executado corretamente, mas a carga é apenas para 1 CPU dos 40 disponíveis. Como eu uso todos os processadores (0-39)?

    
por Wagtail 01.11.2017 / 20:25

1 resposta

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Parece que você deve tentar GNU Parallel . A página inicial está em gnu.org/software/parallel e há uma apresentação em vídeo aqui Vídeos paralelos da GNU .

(Desculpe minha resposta salarial, mas não sei o que é MPI, HPC e PBS)

    
por 01.11.2017 / 21:26

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