Eu tenho um Buch de arquivos (3300) que são o resultado da minha saída de varredura do genoma anacovis2_1_summary_betai_reg.out ... anacovis2_3300_summary_betai_reg.out
e cada arquivo se parece com isso (poucas linhas):
1 4996 0.03907811 0.19369659 -10.43580084 0.00150707 0.00836902 0.06697258
1 4997 0.06213154 0.17373333 -10.98540609 0.00213014 0.00556877 0.15361369
1 4998 -0.00284978 0.19418451 -8.81547738 0.00016505 0.00741737 0.00777931
1 4999 -0.02047544 0.19574268 -9.12692867 -0.00059062 0.00632552 0.03357265
1 5000 -0.01769435 0.18560835 -13.15854481 -0.00038595 0.00540918 0.02543350
2 1 0.04259550 0.20256840 -10.98339784 0.00120126 0.00529516 0.08590396
2 2 -0.10782050 0.17555969 -9.13783036 -0.00355861 0.00689091 0.21784244
2 3 0.02548854 0.18571440 -15.42307129 0.00006131 0.00291038 0.00736142
2 4 0.03084782 0.17813247 -11.99911720 0.00109688 0.00630034 0.06459986
a primeira coluna é de variáveis ambientais variando de 1 a 26. Eu quero passar por cada arquivo e extrair apenas a quarta coluna para cada variável ambiental e salvá-las em um arquivo com um sufixo do número da variável ambiental.
Eu sei como fazê-lo separadamente para cada variável ambiental, por exemplo, para a variável 1
awk '($1==1){print $4>FILENAME"_env1"}'anacovis2_{1..3300}_summary_betai_reg.out
ou para a variável 2
awk '($1==2){print $4>FILENAME"_env2"}'anacovis2_{1..3300}_summary_betai_reg.out
mas leva tempo se eu quiser fazer assim, pergunto-me se posso fazê-lo mais rápido em um loop, por exemplo. Eu tentei algo assim
for i in {1..26};
do awk '($1==i){print $4>FILENAME"_i"}'anacovis2_{1..3300}_summary_betai_reg.out
done
mas não funcionou! Alguém pode me ajudar a resolver isso? obrigado
Sim, existe. Faça isso desta forma apenas com awk .
awk '{print $4>FILENAME"_env"$1}' anacovis2_{1..3300}_summary_betai_reg.out
Para salvar cada env de todos os arquivos em um mesmo arquivo, como env1, env2 e assim por diante, simplesmente solte o FILENAME e execute o comando com {print $4>"env"$1} .