Eu não estou familiarizado com os detalhes do btrfs, mas vejo o risco de que o despejo de metadados de um sistema de arquivos danificado possa estar incompleto.
Sugiro que use dmsetup para configurar um dispositivo de instantâneo e execute btrfs check --repair no instantâneo que você pode simplesmente descartar para obter o estado original.
Este instantâneo irá consumir pouco espaço após a execução do reparo.