"Não me chame de Lenny!" recomenda aos usuários que instalem os cabeçalhos apropriados no Debian 9 via apt-get install linux-headers-$(uname -r|sed 's,[^-]*-[^-]*-,,') . Também é recomendado para instalar os drivers da Nvidia Graphics no wiki aqui .
Isso seria útil para um sistema Debian 9.1 com KDE sem placa gráfica Nvidia? E por que isso não é feito automaticamente? Eu pensei que não era necessário e a CPU funciona como deveria, sem qualquer configuração adicional.
Bem, talvez essa resposta possa ajudar você a entender por que e quando usar cabeçalhos linux.
Em sua pergunta prática, se você não precisa de nenhum pacote que exija explicitamente os cabeçalhos do Linux, não é necessário instalá-los.
Espero que ajude a ver melhor o significado e o uso dos cabeçalhos do Linux.