O arquivo /etc/crontab no Ubuntu é o arquivo crontab do sistema. Ele não deve ser executável e seu formato é diferente do arquivo crontab do usuário.
A diferença no formato é que seu 6º campo é o nome do usuário que a entrada deve ser executada como.
Além disso, % tem um significado especial em arquivos crontab. Todos os % serão alterados para uma nova linha, a menos que tenham escapado como \% (mas vejo que você já tomou precauções contra isso).
Essas coisas são descritas no manual do crontab ( man 5 crontab ):
The format of a cron command is very much the V7 standard, with a number of upward-compatible extensions. Each line has five time and date fields, followed by a command, followed by a newline character (
\n). The system crontab (/etc/crontab) uses the same format, except that the username for the command is specified after the time and date fields and before the command.