Se você tiver acesso SSH ao host:
$ ssh username@server openssl aes-256-cbc -a -salt -in abc.txt -out abc.txt.enc
Isso se conectará ao host server
as username
e executará o comando especificado.
O comando openssl
irá gravar na saída padrão se nenhum arquivo de saída for especificado, o que significa que você pode armazenar o resultado em um arquivo local com
$ ssh username@server openssl aes-256-cbc -a -salt -in abc.txt >abc.txt.enc