Você precisa adicionar ao seu arquivo /etc/apt/sources.list
( source ) :
deb http://http.kali.org/kali kali-rolling main contrib non-free
# For source package access, uncomment the following line
# deb-src http://http.kali.org/kali kali-rolling main contrib non-free
Em seguida, atualize os repositórios e instale os cabeçalhos:
sudo apt-get update
sudo apt-get install linux-headers-$(uname -r)