Eu tentei fazer o que eu acho que você está procurando e funciona sem problemas, por isso estou tendo dúvidas se é isso que você está perguntando:
Eu criei um link simbólico (chamado de "the_symlink") que aponta para um arquivo na minha área de trabalho seguindo um caminho engraçado:
ln -s /tmp/../home/phphil/Desktop/suzuki\ check\ list.ods /home/phphil/the_symlink
o caminho de destino do link é efetivamente aquele definido. Não é modificado pelo sistema
ls -la /home/phphil/symlink
lrwxrwxrwx 1 root root 49 Oct 16 10:27 /home/phphil/symlink -> /tmp/../home/phphil/Desktop/suzuki check list.ods