Isso geralmente acontece se outro processo automatizado tiver bloqueado o banco de dados apt no momento em que você estiver executando o comando de forma interativa.
Candidatos mais prováveis para isso (pelo nome do pacote do Ubuntu):
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unattended-upgrades -
cron-apt
mas existem outros candidatos. Estes são agendados usando cron na maioria dos casos. Confira /etc/crontab , arquivos em /etc/cron.{d,hourly,daily,weekly,monthly} , bem como crontabs de usuário em /var/spool/cron/crontabs .
O que fazer? Simplesmente espere que o outro processo esteja terminado. Verifique se há dpkg em execução ou outros processos relacionados ao apt e os mate se aparecerem parados (consulte os logs antes disso).