De acordo com um tópico em gmane.comp.lang.haskell.gtk2hs.devel , o problema é com gtk2hs-buildtools-0.12.3. 0.12.1 não tem o problema.
Eu mesmo corrigi o problema instalando 0.12.1:
cabal install gtk2hs-buildtools==0.12.1
e o erro que você descreve desaparece.