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Eu mesmo não tenho isso, mas pode ser que haja alguma lentidão no gnome-shell ou no evolution-data-server (tentando preencher o calendário).
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Tenho certeza de que esta é uma decisão de design. A ideia é que as janelas não sejam reorganizadas muito cedo, porque você pode estar no processo de fechar várias delas. Então é realmente irritante quando eles se afastam do seu cursor quando você já estava se movendo em direção a eles.