Estou me deparando com um problema estranho. Eu instalei o shell 3.18 gnome em uma instalação de hortelã. Ele funciona e parece ótimo, mas ele tende a manter alternar aleatoriamente dois menus diferentes de clique direito. Eu tenho que alternar os ícones do show no desktop para ir do segundo menu para o primeiro menu. 
Parece que seu processo nautilus-desktop está travando de alguma forma. Você deve conseguir restaurar a normalidade executando o seguinte comando
nautilus-desktop &
Por conveniência, você pode querer adicionar um atalho de teclado personalizado para este comando.
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