Eu também lidei com os iOTs de vez em quando. A realidade da situação é que nem todas as placas aceitam novos kernels, e muitas vezes alguns hacks feitos pelo fornecedor para algumas versões específicas, e geralmente você está preso a essas versões para sempre.
Do jeito que eu vejo: a documentação Debian afirma claramente que o Clearfog pro é bem suportado pelo kernel mainline atualmente, o que sugere claramente que há algumas limitações para a versão não-profissional.
Além disso, a partir das versões do kernel que você fornece, é fácil ver que seu kernel 3.x foi um pouco abençoado / alterado / hackeado pelo fornecedor, enquanto a versão 4.x que você está usando não é.
Eu gostaria de ficar com o kernel 3.x por enquanto, e ambos preenchendo um bug com o fornecedor, seguindo suas placas para ver se algum patch ou uma versão melhor suportada aparece.