A Canonical provavelmente esqueceu de atualizar apps.ubuntu.com para a nova versão atual do Ubuntu 16.10 ou a versão atual do LTS para o Ubuntu 16.04. Eu não vejo nenhum anúncio em algum lugar que apps.ubuntu.com está obsoleto, parece ser algum tipo de erro da parte deles.
Claramente, esta não é uma ótima experiência, antes de você poder escolher encontrar pacotes em apps.ubuntu.com para a versão mais recente do Ubuntu (além das ferramentas de linha de comando e packages.ubuntu.com), mas agora você não pode. Acho que a maioria das pessoas não percebeu, porque para os aplicativos que existiam nos repositórios do Ubuntu e continuam a existir (como o Blender ), tudo ainda funciona como deveria.
Arquivei estes dois relatórios de bugs sobre isso: