Você desconectou a unidade sem desmontar sua partição.
A desmontagem da partição teria permitido que o SO liberasse as gravações pendentes no disco.
É provável que a partição precise ser executada em fsck da próxima vez que você montá-la, pois seu estado pode estar inconsistente.
Sempre desmonte a partição montada antes de desconectar a unidade em que está localizada!