A solução foi simples ... houve uma incompatibilidade entre algumas bibliotecas. Em particular, reinstalar gtk2-2.20.1-4
packet ( libgtk-x11-2.0.so.0
estava causando alguns problemas) resolveu o problema.
O problema foi encontrado testando o pygtk-demo:
undefined symbol: gdk_pixbuf_format_get_type
Agora o NS-3 está detectando todos os pacotes corretamente e eu consegui instalar o módulo visualizador do PyViz