A escolha óbvia é ODF, tanto para interoperabilidade técnica quanto para o princípio moral.
O formato OOXML foi criado pela Microsoft e, de acordo com este blog , tem falhas de design.
Embora seja uma questão com muitos aspectos subjetivos, a Microsoft é conhecida por conduzir ações duvidosas sobre o processo de votação em comitês normativos e aproveitar abusivamente seu lugar dominante na indústria de software.
Este tópico no slashdot dá visões interessantes sobre como o padrão ISO está sendo debatido no mundo da TI.