Dependendo do seu sistema, suas variáveis de ambiente podem não estar definidas. Você pode chamar tudo usando o caminho completo ou adicionar suas variáveis de ambiente manualmente. Para fazer isso (per man 5 crontab) você pode inserir variáveis no topo do seu crontab no padrão KEY = VALUE
layout
SHELL=/bin/sh
PATH=/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin
@reboot screen -d -m rtorrent