Eu posso dizer a você que essas configurações de lançadores adicionais estão armazenadas no editor de dconf em org - > mate - > painel - > objetos - > object_ X ...
você deve adicionalmente (ou talvez seja o suficiente, se você apenas) excluir o objeto correspondente no arranjo sob org - > mate - > painel - > geral - > object-id-list .
agora você precisa da maneira correta de editar as deconf-settings via terminal!
(talvez eu atualize esta resposta no futuro ...) mas dê uma olhada em gsettings --help e / ou man gsettings !