você deve tentar rsync
é uma ferramenta comumente usada para backups, por isso é capaz de fazer exatamente o que você quer
Eu acho que
rsync -avz /some/dir/ user@machine:/some/other/dir
deve caber perfeitamente na sua conta
- observe o rastreio '/' em / alguns / dir /.
- / some / dir / e / some / other / dir são as dirs com a mesma estrutura
- uma explicação do rsync: link (não importa o item 5)