Desculpe, isso parece estar um pouco atrasado. Acabei de ver sua pergunta.
Para permitir Alt + RMB, a melhor opção é alternar a tecla Alt para a tecla Super (Windows) usando o dconf-tools.
sudo apt-get install dconf-tools
Em Ferramentas do Sistema, você deve agora ter o editor de dconf. Se não, basta digitar:
dconf-editor
em um terminal.
Abra a organização - > gnome - > área de trabalho - > wm e escolha Preferências.
Procure mouse-botão-modificador na lista. Ele será definido como , clique nele para editá-lo e digite:
<Super>
Pressione Enter para definir o valor. Você não precisa "salvá-lo". Basta fechar o editor.
Isso permitirá que você use Alt + RMB no Blender.
Infelizmente, isso desativará a parte Alt do Ctrl + Alt + 0 para alinhar a câmera à exibição atual: -)
Para corrigir isso, mude a configuração no Blender:
Arquivo - > Preferências do usuário - > Entrada - > Visualização 3D - > Visualização 3D (global)
Na parte inferior da lista, você verá Alinhar câmera à vista, com o padrão Ctrl Alt Numpad 0. Clique nele e ele solicitará uma nova combinação de teclas. Eu uso a tecla Super (Windows) em vez de Alt para isso agora, então pressione Ctrl + Super + Numpad 0 para definir isso. Note que isto irá mostrar como "Ctrl Cmd Numpad 0"
Para o seu último problema, não sei por que você está tendo problemas com os atalhos do subsurf. Nunca foi um problema para mim, então não tenho certeza do que aconselhar. Você poderia tentar as configurações de entrada do Blender. Eles estão sob as mesmas preferências do usuário - > Guia de entrada, mas eles estão listados em dois lugares. Você provavelmente precisará atualizá-los na visualização 3D - > Modo de objeto e vista 3D - > Malha.