Não faça isso.
Muitas coisas (provavelmente) irão quebrar se você alterar o interpretador python padrão para python3.
O switch não é simples - embora em 16.04 eu ache que todos os scripts do sistema serão python3, ele provavelmente não será ligado (obrigado @ florian-deisch). Outras distros, como o Arch, fizeram a mudança , mas não tenho certeza se é uma coisa boa, dado que existe um PEP sugerindo explicitamente o contrário ...
Basta usar
#!/usr/bin/env python3
como a linha " shebang " (primeira linha) dos scripts que você deseja executar por python3.