O.k. supondo que você deseja manter esse arquivo / diretório, primeiro renomeie-o para algo mais normal:
# note you need to escape the ~ to make this work
sudo mv /\~ /text.cipher
Depois, você pode copiá-lo para onde quiser ou removê-lo com:
# -r flag only if it is a directory
sudo rm -r /text.cipher
Esta é a maneira mais segura de abordá-lo, na verdade, após a renomeação, é possível verificar se realmente foi esse arquivo que foi renomeado ou se você renomeou involuntariamente seu diretório de usuários.