Eu encontrei uma solução para esse bug que acontece apenas nas instalações do netbeans que vêm dos pacotes do repositório debian, e está relacionado diretamente com as permissões de alguns arquivos na instalação, é uma solução para resolvê-lo:
O plugin do Subversion não foi instalado corretamente
- run:
sudo netbeans
- desinstalar o plug-in do subversion
- sair do netbeans
- run: netbeans (Observe que agora você está executando como um usuário comum e não como root)
- vá para Ferramentas- > Plug-ins > [Configurações]
- adicione repositórios de plugins oficiais
- mude para o separador "plugins disponíveis" e instale o plug-in do subversion
Espero que ajude!