Geralmente, sim.
No caso de variantes que já estão no arquivo principal, a instalação do DE e dos aplicativos relacionados usados por essa variante (por exemplo, o KDE e seus aplicativos padrão no Kubuntu) é tão fácil quanto sudo apt-get install kubuntu-desktop
. Dito isto, porque não há separações entre os DE, você verá programas que são padrão para o Unity aparecer no KDE e os programas que são padrão para o KDE aparecem no Unity. Você pode até ver dois menus de configurações: um para Unity e outro para KDE. (substitua o KDE por Cinnamon aqui)
Pode ser que desde que você estava usando um Gnome PPA, e como o Unity é baseado pelo menos em parte pelo Gnome, versões diferentes / inesperadas de aplicativos do Gnome podem ter causado o Unity parar de funcionar. Em geral, isso não deve acontecer para um DE não relacionado.
Em outra nota, como isso vem de um PPA, cabe ao mantenedor do PPA certificar-se de que os pacotes são de boa qualidade e que não há erros no nível da embalagem.