O que o Wubi faz é criar um arquivo de imagem de disco rígido. Talvez você tenha ouvido falar de "imagens iso" ou "imagens de cd"? É a mesma coisa, exceto que simula um disco rígido. Para o Windows, isso é simplesmente um arquivo grande. Para o Ubuntu, é o disco rígido.
Para usar uma instalação do Wubi, você não precisa formatar seu disco ou algo assim. É apenas uma pasta no sistema de arquivos do Windows. Quer ele funcione ou não no Windows 8, suponho que dependerá do que a Microsoft fez com o gerenciador de inicialização. Se houver alterações significativas do Windows 7, talvez não funcione. Caso contrário, deveria.
Um problema que você deve saber ao usar o Wubi é que, como muitas pessoas abandonaram o Windows, as instalações do Wubi não são tão bem testadas quanto o Ubuntu normal instalado diretamente no seu disco rígido. Qual unidade você instala é irrelevante para o Ubuntu, exceto, obviamente, ele precisa estar disponível, portanto, não instale em uma unidade removível. :)
Se você tiver algum espaço extra em sua unidade, sempre recomendarei uma instalação normal. É tão fácil, mas você precisará escrever um CD ou fazer um pendrive inicializável.