Você deve inicializar a partir da mídia de instalação do Windows (DVD ou USB) e selecionar Recuperação do sistema . Em seguida, selecione Prompt de Comando .
Na janela, você precisa executar
chkdsk /F C:
bootrec /fixboot
bcdboot C:\Windows /s C:
Agora você deve tornar a partição ativa.
diskpart
DISKPART> select disk 0
selected disk 0
DISKPART> select partition 1
selected partition 1
DISKPART> active
partition 1 marked as active
O seu número de partição pode diferir do meu, por isso, execute list partition
antes de o selecionar. E se você selecionar a partição errada, você pode destruir o Ubuntu, então tenha cuidado.
Em seguida, retorne às opções de recuperação do sistema e selecione Reparo de inicialização. Então você pode inicializar o Windows a partir dele, mas não é o objetivo. Agora você deve reiniciar o Ubuntu e rodar no Terminal:
sudo update-grub
Isto deve encontrar o Windows e colocar sua entrada dentro do menu do GRUB.