Você afirma: "Além disso, instalei a arquitetura de 32 bits manualmente para poder usar o skype" Se você precisar de compatibilidade total com o código de 32 bits, deverá instalar a versão i386. Independentemente de você poder resolver este problema editando cuidadosamente o /etc/apt/sources.list
sudo gedit /etc/apt/sources.list
verifique se todos os repositórios aparecem uma vez e apenas uma vez.
ou copie o arquivo original sources.list de um live cd / dvd / usb no mesmo local. Ou melhor ainda consultar isto: Como corrigir a entrada Duplicate sources.list? Um olhar mais atento aos seus avisos deixa claro. Observe atentamente este exemplo e você verá que tem fontes difíceis para arquiteturas diferentes:
W: Duplicate sources.list entry http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty-updates/restricted amd64 Packages (/var/lib/apt/lists/archive.ubuntu.com_ubuntu_dists_trusty-updates_restricted_binary-amd64_Packages)
W: Duplicate sources.list entry http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty-updates/restricted i386 Packages (/var/lib/apt/lists/archive.ubuntu.com_ubuntu_dists_trusty-updates_restricted_binary-i386_Packages)