Esta é tecnicamente uma questão do Steam, não uma questão do Ubuntu, mas aqui vai!
Como o Steam é um gerenciador de jogos, todas as instalações e desinstalações podem ser feitas diretamente dentro do próprio Steam. Aqui estão os passos para desinstalar um jogo:
Abra o Steam e clique no grande botão 'Biblioteca' na parte superior da janela (você verá entre 'Loja' e 'Comunidade').
No lado esquerdo da sua janela, agora haverá uma lista dos jogos que você comprou através do Steam (incluindo os jogos Free-to-play). Só para ser minucioso, vamos nos certificar de que estamos olhando apenas para os jogos que você instalou atualmente em sua máquina, trocando o que é exibido na sua Biblioteca Steam. Deixe o mouse / cursor pairar sobre o grande botão da Biblioteca em que você clicou antes. Um menu pop-up deve aparecer logo abaixo da palavra Library - clique onde diz 'Installed'. Você pode obter o mesmo menu pop-up clicando no botão diretamente abaixo da grande "Biblioteca", conforme mostrado abaixo:
Agora, encontre o título que deseja desinstalar na lista mostrada no lado esquerdo do menu e clique com o botão direito do mouse no nome dele. Em seguida, clique em "Excluir conteúdo local".
Você será solicitado a confirmar o processo. Quando o Steam terminar, seu jogo foi desinstalado.
Agora, sobre a exclusão de todos os arquivos "relacionados ao Counter Strike Source, para que da próxima vez se eu os instalar, ele não mantenha as configurações da instalação anterior" - não é assim que o Steam funciona. O Steam é um gerenciador de jogos. No Linux você pode fazer qualquer coisa, e certamente você pode remover qualquer vestígio de Counter-Strike Source do seu disco rígido, mas isso não é o mesmo que desinstalá-lo. No final do dia, se você não desinstalar através do próprio Steam, ainda haverá uma referência ao jogo dentro do Steam, e você ainda terá que fazer o processo que acabamos de passar para 'Excluir conteúdo local' mesmo que seja apenas para remover a referência ao jogo de dentro do Steam. E, infelizmente, no que diz respeito às configurações do jogo, elas nem sempre são armazenadas localmente em sua máquina; elas também são armazenadas em servidores Steam (especialmente para salvar arquivos de jogos de um único jogador - mas isso é bom!) . No entanto, eu nunca notei um jogo Valve multiplayer que realmente faz isso. Toda vez que eu re-instalar o Counter-Strike ou o Team Fortress eu tenho que passar pelo processo de reconfigurar controles e configurações de exibição, então eu acho que você está completamente seguro.