Os seguintes comandos devem ajudá-lo:
gsettings get org.gnome.desktop.interface document-font-name
gsettings get org.gnome.desktop.interface font-name
gsettings get org.gnome.desktop.interface monospace-font-name
No meu sistema eu recebo:
$ gsettings get org.gnome.desktop.interface document-font-name
'Sans 11'
$ gsettings get org.gnome.desktop.interface font-name
'Ubuntu 11'
$ gsettings get org.gnome.desktop.interface monospace-font-name
'Ubuntu Mono 13'