Acho que a pessoa que está melhor equipada para responder a essa pergunta é você, testando as duas coisas e fazendo as mesmas tarefas e comparando-as.
Ambos WM, não usam composição para que apresentem os aplicativos diretamente na tela, o que pode ser mais rápido se você não tiver uma placa gráfica de ponta.
Pelo que eu li, parece que o Gnome Fallback poderia ser um pouco mais rápido, mas não há testes de dados reais para provar isso.
Então, meu conselho é, instalar ambos, executar o mesmo aplicativo (reproduzir um vídeo, por exemplo) em ambos e medir os tempos.