Eu notei que um processo mysql estava começando toda vez que eu tentava atualizar e estava comendo todos os meus processadores. Esse mesmo processo parou depois que eu parei o processo de atualização. Eu era incapaz de determinar a causa desse processo mysql sendo preso, então eu segui o conselho a partir daqui: " Falha ao gerar o processo principal do mysql: impossível executar: Nenhum arquivo ou diretório ".
Depois de executar o upgrade do apt-get, funcionou sem problemas.
Espero que isso ajude.