Eu não tive problemas por causa de sua remoção no Lubuntu 12.10. É considerado um "pacote meta" e não tem nenhuma consequência.
Você pode ler isto: link .
Para citar de lá:
Quando você quiser remover um programa do lubuntu, você pode ser informado de que, ao fazer isso, ele removerá o lubuntu-desktop. O pacote lubuntu-desktop é usado apenas para a instalação do lubuntu e pode ser removido com segurança.
Lubuntu-desktop é o que é chamado de meta-pacote que, simplesmente, é apenas uma lista do que instalar. É uma decisão de design que todos os pacotes incluídos no lubuntu-desktop dependem dele, de modo a poder usar a opção --no-install-recommends quando a instalação inicial ocorrer, evitando assim a instalação de programas não essenciais.
E aqui está mais sobre o assunto: Re: [Lubuntu-desktop] metapackage lubuntu-desktop - Recomenda Dependências vs .