2017-08-21T10:02:40.035955Z 0 [ERROR] unknown variable 'Max_heap_table_size=380M'
Parece que este é provavelmente um bom lugar para começar. Você pode ter certeza de que esta diretiva está no lugar certo em seu arquivo de configuração? Deve estar na seção [mysqld]
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Analisei seus erros do AppArmor e parece que essas falhas de auditoria provavelmente não afetarão o servidor em execução - só preciso corrigir a configuração do servidor.