Um pacote pode ser instalado automaticamente se outro pacote que você instalar manualmente depender dele.
Você pode rastrear dependências de pacotes com aptitude . Eu corri isso no meu computador:
$ aptitude why chromium-codecs-ffmpeg-extra
i ubuntu-restricted-extras Depends ubuntu-restricted-addons
i A ubuntu-restricted-addons Recommends chromium-codecs-ffmpeg-extra
ubuntu-restricted-extras depende de ubuntu-restricted-addons , o que recomenda chromium-codecs-ffmpeg-extra . De fato, eu instalei manualmente ubuntu-restricted-extras , é por isso que chromium-codecs-ffmpeg-extra está instalado no meu sistema. Provavelmente é por isso que você também tem.