Seria uma solução melhor e mais confiável executar o comando para abrir uma sessão de terminal em vez de pressionar ctrl + alt + t por meio de um comando. Se você estiver usando o terminal gnome padrão no Ubuntu 14.04 (que provavelmente será aberto com ctrl + alt + t), tente:
gnome-terminal --working-directory=/your/path/here
Isso deve abrir uma sessão de terminal nesse diretório sem problemas relacionados à entrada que acompanham as emulações de teclas. Também tenha em mente que nem todo mundo tem o atalho ctrl + alt + t configurado, eles podem ter desativado.
Espero que isso tenha ajudado você!