Seu http do apache está sendo executado com o mod_evasive ativado.
Este módulo é a camada de proteção para ataque DDoS no servidor da web.
De alguma forma, mod_evasive detecta seu acesso como tentativa de DDoS. Há log em /var/log/mod_evasive
que escreve todas as informações. Você pode começar por aí para verificar porque detectou seu acesso como tentativa de DDoS.
Supondo que você instale tudo usando o repositório oficial do Ubuntu, você pode desativar o mod_evasive através do comando a2dismod mod-evasive
e recarregar o seu apache.