Se você quiser usar python3 em vez de python2.7 apenas quando você executar manualmente aplicativos python, basta adicionar:
alias python='python3'
ao seu arquivo ~/.bash_aliases
. (O arquivo pode estar vazio, dependendo de você ter adicionado aliases no passado).
Os aplicativos que não sejam os que você inicia manualmente continuarão usando python2.7 ou python3 como antes.