Experimente meu addon quickFilters . Você alterna para o modo de aprendizado e, em seguida, move o email manualmente uma vez. Ele trará um assistente para que você possa ensinar um filtro para fazer isso automaticamente a partir de então. Ele também se integra bem com o meu outro addon, o QuickFolders. Também recomendo usar o " Copiar enviado para o atual " mantenha as conversas filtradas juntas e o atalho [N] para ir para o próximo e-mail não lido.
No que diz respeito à Atualização, talvez você possa definir seus filtros para não serem executados quando "Verificando e-mails", mas apenas executados manualmente; você ainda tem o problema de que eles serão aplicados a todos os e-mails da pasta, portanto, seria necessário adicionar um mecanismo para evitar a filtragem de e-mails não lidos.