Outra maneira de definir as coisas do jeito que estavam, pelo menos para o Ambiance e o Radiance, é executar:
sudo apt-get install --reinstall light-themes
Isso simplesmente restaurará os temas Ambiance e Radiance para a versão que está nos repositórios.
Além disso, para o futuro, talvez seja melhor copiar o tema que você planeja modificar para a subpasta ~/.themes oculta em sua pasta pessoal. Então, faça o que quiser lá. (Se ~/.themes não existir, basta criá-lo.) A vantagem é que você tem o original como backup e não precisa de sudo para editar nenhum arquivo em ~/.themes .